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Notre objectif dans l'axe 2 est de connaitre le déterminisme génétique et génomique de l’adaptation de Z. tritici à ses hôtes (espèce, variété, population hétérogène) et à son environnement abiotique (température) et d'en caractériser la diversité allélique au sein des populations.

2.1. Développer des approches de cartographie QTL, d’associations génotype-phénotype ou génotype-environnement, de scans génomiques, ainsi que de méta-analyse de données QTL et GWAS.

2.2. Identifier les couples R–AVR et étudier les conséquences phénotypiques de la variabilité allélique de ces couples (génétique de la résistance, approche de coGWAS).

2.3. Suivre les dynamiques évolutives des gènes impliqués dans l’adaptation au sein de populations de Z. tritici provenant d’environnements contrastés (intérêt pour l’épidémiosurveillance).