Frédéric Suffert

Suffert Frédéric

Frédéric Suffert

 
photo perso Frédéric Suffert
Frédéric Suffert  |  Ingénieur de recherche en épidémiologie végétale  |  Ing Agro, PhD, HDR
INRAE BIOGER  | Campus Agro Paris-Saclay, 22 place de l’Agronomie, 91120 Palaiseau  |  Accès
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Présentation

Je suis épidémiologiste en santé végétale à INRAE. Ingénieur agronome de l'Institut Agro Rennes-Angers spécialisé en protection des cultures, j'ai un doctorat en phytopathologie et une HDR. Je travaille dans l'unité BIOGER sur le Campus Agro Paris-Saclay à Palaiseau. J'y co-anime l'équipe ADEP qui s'intéresse aux processus adaptatifs et épidémiologiques des interactions blé-champignons phytopathogènes. Je mène des recherches sur l'épidémiologie de la septoriose du blé (Zymoseptoria tritici) en m'appuyant sur une approche scientifique de l'agroécologie. J'étudie les processus impliqués dans le développement de cette maladie, aux déterminants et aux conséquences de la reproduction sexuée de Z. tritici (biologie fongique, écologie des résidus de culture source d'inoculum primaire, etc.), et à la dynamique adaptative des populations pathogènes (profils de virulence et agressivité) dans des environnements hétérogènes (déploiement de résistances dans des associations variétales, fluctuations saisonnières de température et d'humidité, etc.). J'ai assuré plusieurs (co-)direction de thèses (ED ABIES) sur ces thématiques. Je m'intéresse également à l'impact des relations entre compartiments cultivés et sauvages (rôle des hôtes alternants et alternatifs, plantes de services vs. de disservices, etc.) sur la dynamique des maladies à cycle biologique complexe. J'ai initié en 2023 un programme de recherche sur l'épidémiologie de la rouille noire (Puccinia graminis f. sp. tritici), considérée comme réémergente en Europe. Ancien auditeur de de l'IHEDN, j'aborde ponctuellement des problématiques de cindynique appliquées à l'épidémiosurveillance et la biosécurité des cultures (ex. veille sur l'agroterrorisme accessible sur la page C&Aw). Je suis membre du CES Risques Biologiques pour la Santé des Végétaux de l'ANSES et participe à des travaux d'expertise pour INRAE (ex. ESCo INRAE RegulNat). Je suis membre du conseil scientifique du département INRAE SPE et de la cellule VSI de la plateforme d'Épidémiosurveillance en Santé Végétale (ESV). Je suis administrateur de la Société Française de Phytopathologie (SFP) et éditeur associé de la revue Journal of Plant Pathology. Je suis membre de l'Association des Naturalistes de Yvelines (ANY) et photographe admirateur de micromycètes (rouilles et oïdiums) que j'immortalise lors de "balades phytopathologiques".

Références

2024

Suffert F, Le Prieur S, Gélisse S, Dzialo E, Saintenac C, Marcel TC. 2024. Estimating the frequency of virulence against an Stb gene in Zymoseptoria tritici populations by bulk phenotyping on checkerboard microcanopies of wheat NILs. Plant pathology, accepté avec modifications https://doi.org/10.1101/2023.12.18.572116 [pdf]

• Collectif. 2024. Pesticides : « Nous, chercheurs et chercheuses, dénonçons une mise au placard des connaissances scientifiques ». Tribune, Le Monde, 8 février 2024 https://www.lemonde.fr/idees/article/2024/02/07/pesticides-nous-chercheurs-et-chercheuses-denoncons-une-mise-au-placard-des-connaissances-scientifiques_6215195_3232.html [pdf tribune] [chronique France Inter]

• Meyer KJG, Leconte M, Vidal T, Goyeau H, Suffert F. 2024. Is thermal aptitude a pivotal driver in the establishment of recent Puccinia striiformis f. sp. tritici lineages in Europe? Journal of Plant Pathology, on line https://doi.org/10.1007/s42161-024-01590-7 [pdf] [point presse]

• Fontyn C, Meyer KJG, Boixel A-L, Picard C, Destanque A, Marcel TC, Suffert F, Goyeau H. 2024. Can higher aggressiveness effectively compensate for a virulence deficiency in plant pathogen? A case study of Puccinia triticina’s fitness evolution in a diversified varietal landscape. bioRxiv https://doi.org/10.1101/2023.06.09.544363 [pdf]

• Bourgeois T, Prado S, Suffert F*, Salmon S*. 2024. The collembolan Heteromurus nitidus grazes the wheat fungal pathogen Zymoseptoria tritici on infected tissues: opportunities and limitations for bioregulation. Pest Management Science, en ligne https://doi.org/10.1002/ps.8026 [pdf] [point presse] [*contribution égale]

• Sarthou J-P, Sester M, Lamichhane J-R, Aubertot J-N, Sarthou V, Suffert F. 2024. Effet des pratiques d’ACS sur les maladies et leurs conséquences sur l’état sanitaire des cultures. In: L’agriculture de conservation des sols, Cordeau S, Maron PA, Sarthou JP, Chauvel B (Eds), Quae Editions (France), sous presse https://www.quae.com/produit/1776/9782759235667/l-agriculture-de-conservation-des-sols

2023

• Boixel A-L, Goyeau H, Berder J, Moinard J, Suffert F, Soubeyrand S, Sache I, Vidal T. 2023. A landscape-scale field survey demonstrates the role of wheat volunteers as a local and diversified source of leaf rust inoculum. Scientific Reports 13: 392 https://doi.org/10.1038/s41598-023-47499-6 [pdf]

• Barroso-Bergada D, Tamaddoni-Nezhad D, Varghese D, Vacher C, Galic N, Laval V, Suffert F, Bohan DA. 2023. Unravelling the web of dark interactions: explainable inference of the diversity of microbial interactions. Advances in Ecological Research 68: 155-183 https://doi.org/10.1016/bs.aecr.2023.09.005 [pdf]

• Vialatte A (coord.), Martinet V (coord.), Tibi A (coord.), Alignier A, Angeon V, Bedoussac L, Bohan DA, Bougherara D, Carpentier A, Castagneyrol B, Cordeau S, Courtois P, Deguine J-P, Doehler M, Enjalbert J, Fabre F, Féménia F, Fréville H, Goulet F, Grateau R, Grimonprez B, Gross N, Hannachi M, Jeanneret P, Labarthe P, Launay M, Lelièvre V, Lemarié S, Martel G, Masson A, Navarrete M, Plantegenest M, Ravigné V, Rusch A, Suffert F, Tapsoba A, Thoyer S. 2022. Protéger les cultures en augmentant la diversité végétale des espaces agricoles. Rapport de l’expertise scientifique collective, INRAE (France), 954 p. https://dx.doi.org/10.17180/q7wm-q442 [pdf]

• Bourgeois TP, Suffert F, Durya G, Biaua G, Lacoste S, Prado S, Dupont J, Salmon S. 2023. Dietary preferences of Heteromurus nitidus (Collembola) among wheat fungal communities: implications for bioregulation of two widespread pathogens. Applied Soil Ecology 188: 104897 https://doi.org/10.1016/j.apsoil.2023.104897 [pdf]

• Feurtey A, Lorrain C, McDonald MC, Milgate A, Solomon P, Warren R, Puccetti G, Scalliet G, Torriani S, Gout L, Marcel T, Suffert F, Alassimone J, Lipzen A, Yoshinaga Y, Daum C, Barry K, Grigoriev I, Goodwin SB, Genissel A, Seidl MF, Stukenbrock EH, Lebrun M-H, Kema G, McDonald BA, Croll D. 2023. A thousand-genome panel retraces the global spread and climatic adaptation of a major fungal crop pathogen. Nature Communications 14: 1059 https://doi.org/10.1038/s41467-023-36674-y [pdf]

• Fontyn C, Meyer K, Boixel A-L, Delestre G, Piaget E, Picard C, Suffert F,  Marcel TC,  Goyeau H. 2023. Evolution within a given virulence phenotype (pathotype) is driven by changes in aggressiveness: a case study of French wheat leaf rust populations. Peer Community Journal, section Infections 3: e39 https://doi.org/10.24072/pcjournal.264 [pdf]

• Karisto P, Suffert F, Mikaberidze A. 2023. Spatially-explicit modeling improves empirical characterization of dispersal. Plant Environment-Interactions 4: 86-96 https://doi.org/10.1002/pei3.10104 [pdf]

• Langlands-Perry C, Pitarch A, Lapalu N, Cuenin M, Bergez C, Noly A, Amezrou R, Gélisse S, Barrachina C, Parrinello H, Suffert F, Valade R, Marcel TC. 2023. Quantitative and qualitative plant-pathogen interactions call upon similar pathogenicity genes with a spectrum of effects. Frontiers in Plant Science 14:1128546 https://doi.org/10.3389/fpls.2023.1128546 [pdf]

• Reignault P, Sache I, Choquer M, Corio-Coster MF, Dellagi A, Suffert F. 2023. Phytopathologie. 2023. De Boeck Supérieur (Belgique) 384 p. https://www.deboecksuperieur.com/ouvrage/9782807302884-phytopathologie

Suffert F. 2023. A la découverte des premières rouilles printanières en lisière de forêt de Bois-d’Arcy (Les Clayes-sous-Bois, Yvelines, FR). Compte rendu de la sortie mycologie et botanique organisée le 15 avril 2023 pour l’Association des Naturalistes des Yvelines (ANY) https://doi.org/10.5281/zenodo.7840443 [pdf]

2022

• Tibi A (coord.), Martinet V (coord.), Vialatte A (coord.), Alignier A, Angeon V, Bohan DA, Bougherara D, Cordeau S, Courtois P, Deguine J-P, Enjalbert J, Fabre F, Fréville H, Grateau R, Grimonprez B, Gross N, Hannachi M, Launay M, Lelièvre V., Lemarié S, Martel G, Navarrete M, Plantegenest M, Ravigné V., Rusch A, Suffert F, Thoyer S. 2022. Protéger les cultures en augmentant la diversité végétale des espaces agricoles. Synthèse du rapport de l’expertise scientifique collective, INRAE (France), 86 p. https://www.inrae.fr/actualites/augmenter-diversite-vegetale-espaces-agricoles-proteger-cultures [pdf]

• Fontyn C, Zippert A-C, Delestre G, Marcel TC, Suffert F, Goyeau H. 2022. Is virulence phenotype evolution driven exclusively by Lr gene deployment in French Puccinia triticina populations? Plant Pathology 71: 1511-1524 https://doi.org/10.1111/ppa.13599 [pdf]

• Karisto P, Suffert F, Mikaberidze A. 2022. Measuring splash-dispersal of a major wheat pathogen in the field. PhytoFrontiers, 2: 30-40 https://doi.org/10.1094/PHYTOFR-05-21-0039-R [pdf]

• Lapalu N, Simon A, Demenou B, Paumier D, Guillot M-P, Gout L, Suffert F, Valade R. 2022. Complete genome sequences of Septoria linicola: a resource for studying a damaging flax pathogen. Molecular Plant-Microbe Interactions https://doi.org/10.1094/MPMI-09-22-0185-A [pdf]

• Rodriguez-Algaba J, Hovmøller MS, Schulz P, Hansen JG, Lezaun JA, Joaquim J, Randazzo B, Czembor P, Zemeca L, Slikova S, Hanzalová A, Holdgate S, Wilderspin S, Mascher F, Suffert F, Leconte M, Flath K, Justesen AF. 2022. Stem rust on barberry species in Europe: Host specificities and genetic diversity. Frontiers in Genetics 13: 988031 https://doi.org/10.3389/fgene.2022.988031 [pdf]

• Barroso-Bergadà D, Massot M, Vignolles N, Faivre d’Arcier J, Chancerel E, Guichoux E, Walker A-S, Vacher C, Bohan DA, Laval V, Suffert F. 2022. Metagenomic next⁃generation sequencing (mNGS) data reveals the phyllosphere microbiome of wheat plants infected by the fungal pathogen Zymoseptoria tritici. Phytobiomes Journal, sous presse https://doi.org/10.1094/PBIOMES-02-22-0008-FI [pdf]

• McDonald BA, Suffert F, Bernasconi A, Mikaberidze A. 2022. How large and diverse are field populations of fungal plant pathogens? The case of Zymoseptoria tritici. Evolutionary Applications 15: 1360-1373 https://doi.org/10.1111/eva.13434 [pdf]

• Bernard F, Chelle M, Riahi El Kamel O, Pincebourde S, Sache I, Suffert F. 2022. Daily fluctuations in leaf temperature modulate the development of a foliar pathogen. Agricultural Forest Meteorology 322: 109031 https://doi.org/10.1016/j.agrformet.2022.109031 [pdf]

• Valade R, Boixel A-L, Meyer K, Suffert F. 2022. 2021, l’odyssée de l’espèce Puccinia graminis f. sp. tritici : retour sur une année exceptionnelle qui pose la question de l’endémicité de la rouille noire du blé en France et incite à maintenir l’effort d’épidémiosurveillance en systèmes céréaliers. Phytoma - La santé des végétaux 754: 45-50 http://www.phytoma-ldv.com/revue-1850-PHYTOMA-754 [pdf]

Suffert F. 2022. La Russie et la Chine instrumentalisent-elles la réglementation phytosanitaire à des fins géopolitiques ? The Conversation, 25 avril 2022, https://bit.ly/biogeopolitique [pdf]

• Orellana-Torrejon C, Vidal T, Gazeau G, Boixel A-L, Gélisse S, Lageyre J, Saint-Jean S, Suffert F. 2022. Multiple scenarios for sexual crosses in the fungal pathogen Zymoseptoria tritici on wheat residues: potential consequences for virulence gene transmission. Fungal Genetics and Biology 163: 103744 https://doi.org/10.1016/j.fgb.2022.103744 [pdf]

• Orellana-Torrejon C, Vidal T, Saint-Jean S, Suffert F. 2022. The impact of wheat cultivar mixtures on virulence dynamics in Zymoseptoria tritici populations persist after interseason sexual reproduction. Plant Pathology 71: 1537-1549 https://doi.org/10.1111/ppa.13577 [pdf] [point presse#1] [point presse#2]

• Orellana-Torrejon C, Vidal T, Boixel A-L, Gélisse S, Saint-Jean S, Suffert F. 2022. Annual dynamics of Zymoseptoria tritici populations in wheat cultivar mixtures: a compromise between the efficiency and durability of a recently broken-down resistance gene? Plant Pathology 71: 289-303 https://doi.org/10.1111/ppa.13458 [pdf] [point presse#1] [point presse#2] [point presse#3]

• Boixel AL, Chelle M, Suffert F. 2022. Patterns of thermal adaptation in a worldwide plant pathogen: local diversity and plasticity reveal two-tier dynamics. Ecology and Evolution 12: e8515 https://doi.org/10.1002/ece3.8515 [pdf]

• Boixel AL, Gélisse S, Marcel TC, Suffert F. 2022. Differential tolerance of Zymoseptoria tritici to altered optimal moisture conditions during the early stages of wheat infection. Journal of Plant Pathology 104: 495–507 https://doi.org/10.1007/s42161-021-01025-7 [pdf]

Suffert F, Suffert M. 2022. ‘Phytopathological strolls’ in the dual context of COVID-19 lockdown and IYPH2020: transforming constraints into an opportunity for public education about plant pathogens. Plant Pathology 71: 30-42 https://doi.org/10.1111/ppa.13430 [pdf] [planches photo] [point presse] [présentation orale]

• Vialatte A, Tibi A, Alignier A, Angeon V, Bedoussac L, Bohan DA, Bougherara D, Carpentier A, Castagneyrol B, Cordeau S, Courtois P, Deguine J-P, Enjalbert J, Fabre F, Féménia F, Fréville H, Goulet F, Grateau R, Grimonprez B, Gross N, Hannachi M, Jeanneret P, Kuhfuss L, Labarthe P, Launay M, Lefebvre M, Lelièvre V, Lemarié S, Martel G, Masson A, Navarrete M, Plantegenest M, Ravigné V, Rusch A, Suffert F, Tapsoba A, Thérond O, Thoyer S, Martinet V. 2022. Promoting crop pest control by plant diversification in agricultural landscapes: a conceptual framework for analysing feedback loops between agro-ecological and socio-economic effects. Advances in Ecological Research 65: 133-165 https://doi.org/10.1016/bs.aecr.2021.10.004 [pdf]

2021

• Vidal T, Gauffreteau A, Enjalbert J, Suffert F. 2021. Mélanger les variétés pour construire des peuplements plus résistants aux bioagresseurs. In: L’immunité des plantes: pour des cultures résistantes aux maladies, Lannou C, Carenta C, Roby D, Ravigné V, Hannachi M, Moury B (Eds), Quae Editions (France), p. 221-232 ISBN 978-2-7592-3233-8 [pdf]

• Ben Krima S, Slim A, Gélisse S, Houki H, Nadaud I, Sourdille P, Yahyaoui A, Ben M’Barek S, Suffert F, Marcel TC. 2021. Life story of Tunisian durum wheat landraces revealed by their genetic and phenotypic diversity. bioRxiv https://doi.org/10.1101/2020.08.14.251157 [pdf]

• Laval V, Kerdraon L, Barret M, Boudier B, Liabot A-L, Marais C, Balesdent M, Fischer-Le Saux M, Suffert F. 2021. Assessing the cultivability of bacteria and fungi from arable crop residues using metabacoding data as a reference. Diversity 13: 404 https://doi.org/10.3390/d13090404 [pdf] [point presse]

• Paumier D, Bammé B, Penaud A, Valade R, Suffert F. 2021. First report of the sexual stage of the flax pathogen Mycosphaerella linicola in France and its impact on pasmo epidemiology. Plant Pathology 70: 475-483 https://doi.org/10.1111/ppa.13296 [pdf]

2020

• Kerdraon L, Barret M, Balesdent M, Suffert F*, Laval V*. 2020. Impact of a resistance gene against a fungal pathogen on the plant host residue microbiome: the case of the Leptosphaeria maculans-Brassica napus pathosystem. Molecular Plant Pathology 21: 1445-1558 https://doi.org/10.1111/mpp.12994 [pdf] [*contribution égale]

2019

• Kerdraon L, Barret M, Laval V, Suffert F. 2019. Differential dynamics of microbial community networks help identify microorganisms interacting with residue-borne pathogens: the case of Zymoseptoria tritici in wheat. Microbiome 7: 125 https://doi.org/10.1186/s40168-019-0736-0 [pdf]

• Kerdraon L, Laval V, Suffert F. 2019. Microbiomes and pathogen survival in crop residues, an ecotone between plant and soil. Phytobiomes Journal 3: 246-255 https://doi.org/10.1094/PBIOMES-02-19-0010-RVW [pdf]

• Kerdraon L, Balesdent M-H, Barret M, Laval V, Suffert F. 2019. Crop residues in wheat-oilseed rape rotation system: a pivotal, shifting platform for microbial meetings. Microbial Ecology 4: 931-945 https://doi.org/10.1007/s00248-019-01340-8 [pdf]

• Morais D, Duplaix C, Sache I, Laval V, Suffert F*, Walker A-S*. 2019. Overall stability in the genetic structure of a Zymoseptoria tritici population from epidemic to interepidemic stages at a small spatial scale. European Journal of Plant Pathology 154: 423-436 https://doi.org/10.1007/s10658-018-01666-y [pdf] *contribution égale

• Boixel AL, Delestre G, Legeay J, Chelle M, Suffert F. 2019. Phenotyping thermal responses of yeasts and yeast-like microorganisms at the individual and population levels: proof-of-concept, development and application of an experimental framework to a plant pathogen. Microbial Ecology 78: 42-56 https://doi.org/10.1007/s00248-018-1253-6 [pdf]

2018

Suffert F, Thompson R. 2018. Some reasons why the latent period should not always be considered constant over the course of a plant disease epidemic. Plant Pathology 67: 1831-1840 https://doi.org/10.1111/ppa.12894 [pdf]

Suffert F, Delestre G, Gélisse S. 2018. Sexual reproduction in the fungal foliar pathogen Zymoseptoria tritici is driven by antagonistic density-dependence mechanisms. Microbial Ecology 77: 110-123 https://doi.org/10.1007/s00248-018-1211-3 [pdf]

Suffert F, Goyeau H, Sache I, Carpentier F, Gélisse S, Morais D, Delestre G. 2018. Epidemiological trade-off between intra- and interannual scales in the evolution of aggressiveness in a local plant pathogen population. Evolutionary Applications 11: 768-780 https://doi.org/10.1111/eva.12588 [pdf]

2017

• Soubeyrand S, Garreta V, Monteil C, Suffert F, Goyeau H, Berder J, Berge O, Moinard J, Fournier E, Tharreau D, Morris C, Sache I. 2017. Testing differences between pathogen compositions with small samples and sparse data. Phytopathology 107: 1199-1208 https://doi.org/10.1094/PHYTO-02-17-0070-FI [pdf]

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Suffert F. 2017. Characterization of the threat resulting from plant pathogens use as anti-crop bioweapons: an EU perspective on agroterrorism. In: Gullino ML, Stack J, Fletcher J, Mumford J (Eds.), Practical tools for plant and food biosecurity, Springer, p. 31-60 ISBN 978-3-319-46897-6 [pdf]

2016

Suffert F, Delestre G, Carpentier F, Walker AS, Gazeau G, Gélisse S, Duplaix C. 2016. Fashionably late partners have more fruitful encounters: impact of the timing of co-infection and pathogenicity on sexual reproduction in Zymoseptoria tritici. Fungal Genetics and Biology 92: 40-49 http://dx.doi.org/10.1016/j.fgb.2016.05.004 [pdf]

• Morais D, Gélisse S, Laval V, Sache I, Suffert F. 2016. Inferring the origin of primary inoculum of Zymoseptoria tritici from differential adaptation of resident and immigrant populations to wheat cultivars. European Journal of Plant Pathology 145: 393-404 http://dx.doi.org/10.1007/s10658-015-0853-y [pdf]

• Morais D, Sache I, Suffert F*, Laval V*. 2016. Is onset of Septoria tritici blotch epidemics related to local availability of ascospores? Plant Pathology 65: 250-260 http://dx.doi.org/ 10.1111/ppa.12408 [pdf] [*contribution égale]

2015

Suffert F, Ravigné V, Sache I. 2015. Seasonal changes drive short-term selection for fitness traits in the wheat pathogen Zymoseptoria tritici. Applied and Environmental Microbiology 81: 6367-6379 http://dx.doi.org/10.1128/AEM.00529-15 [pdf]

• Siou D, Gélisse S, Laval V, Suffert F, Lannou C. 2015. Mutual exclusion between fungal species of the FHB complex in a wheat spike. Applied and Environmental Microbiology 81: 4682-4689. http://dx.doi.org/10.1128/AEM.00525-15 [pdf]

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• Siou D, Gélisse S, Laval V, Repinçay C, Bourdat-Deschamps M, Suffert F, Lannou C. 2015. Interactions between head blight pathogens: consequences on disease development and toxins production in wheat spikes. Applied and Environmental Microbiology 81: 957-965 http://dx.doi.org/10.1128/aem.02879-14 [pdf]

2014

• Gautier A, Marcel T, Confais J, Crane C, Kema G, Suffert F, Walker A-S. 2014. Development of a rapid multiplex SSR genotyping method to study populations of the plant pathogenic fungus Mycosphaerella graminicola. BMC Research Notes 7: 373 http://dx.doi.org/10.1186/1756-0500-7-373 [pdf]

2013

• Siou D, Gelisse S, Laval V, Repinçay C, Canalès R, Suffert F, Lannou C. 2013. Effect of wheat spike infection timing on Fusarium head blight development and mycotoxin accumulation. Plant Pathology 63: 390-399 http://dx.doi.org/10.1111/ppa.12106 [pdf]

Suffert F, Sache I, Lannou C. 2013. Assessment of quantitative traits of aggressiveness in Mycosphaerella graminicola on adult wheat plants. Plant Pathology 62: 1330-1341 http://dx.doi.org/10.1111/ppa.12050 [pdf]

• Bernard F, Sache I, Suffert F, Chelle M. 2013. The development of a foliar fungal pathogen does react to leaf temperature! New Phytologist 198: 232-240 http://dx.doi.org/10.1111/nph.12134 [pdf]

2012

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• Ben Slimane R, Bancal P, Suffert F, Bancal M-O. 2012. Localized septoria leaf blotch lesions in winter wheat flag leaf do not accelerate apical senescence during necrotrophic stage. Journal of Plant Pathology 94: 543-553 http://dx.doi.org/10.4454/JPP.FA.2012.055 [pdf]

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Suffert F, Sache I, Lannou C. 2011. Early stages of Septoria tritici blotch epidemics of winter wheat: Build-up, overseasoning, and release of primary inoculum. Plant Pathology 60: 166-177 http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-3059.2010.02369.x [pdf]

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2010

Suffert F. 2010. Emergences épidémiologiques non-conventionnelles et analyse de risque : le cas de la biosécurité agricole et de l'agroterrorisme. In: Barnouin J et Sache I (Eds), Les maladies émergentes. Épidémiologie chez le végétal, l'animal et l'homme, Quae Editions (France), p. 373-384 ISBN 978-2-7592-0510-3

• Stack J, Suffert F, Gullino ML. 2010. Bioterrorism: A threat to plant biosecurity? In: Gullino ML et Strange RN (Eds), The role of plant pathology in food safety and food security, Springer, p. 115-132 http://dx.doi.org/10.1007/978-1-4020-8932-9_10 [pdf]

• Gosme M, Suffert F, Jeuffroy MH. 2010. Intensive versus low-input cropping systems: What is the optimal partitioning of agricultural area in order to reduce pesticide use while maintaining productivity? Agricultural Systems 103: 110-116 http://dx.doi.org/10.1016/j.agsy.2009.11.002 [pdf]

2009

• Barbier M, Sache I, Prete G, Suffert F. 2009. Cultures en péril ? L'affaire de tous. Pour La Science 65: 110-115 [pdf]

Suffert F, Latxague E, Sache I. 2009. Plant pathogens as agroterrorist weapons: Assessment of the threat for European agriculture and forestry. Food Security 1: 221-232 http://dx.doi.org/10.1007/s12571-009-0014-2 [pdf]

2008

Suffert F, Barbier M, Sache I, Latxague E. 2008. Biosécurité des cultures et agroterrorisme. Une menace, des questions scientifiques et une opportunité : réactiver un dispositif d’épidémiovigilance. Le Courrier de l'Environnement 56: 67-86 [pdf]

Suffert F, Lucas JM. 2008. Lateral roots of carrot have a low impact on alloinfections involved in a cavity spot epidemic caused by Pythium violae. Journal of General Plant Pathology 74: 296-301 http://dx.doi.org/10.1007/s10327-008-0104-6 [pdf]

Suffert F, Delalande D, Prunier M, Andrivon D. 2008. Modulation of primary and secondary infections in epidemics of carrot cavity spot through agronomic management practices. Plant Pathology 57: 109-121 http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-3059.2007.01708.x [pdf]

Suffert F, Montfort F. 2008. Pathometric relationships reveal epidemiological processes involved in carrot cavity spot epidemics. European Journal of Plant Pathology 122: 425-436 http://dx.doi.org/10.1007/s10658-008-9309-y [pdf]

2007

Suffert F. 2007. Cavity spot de la carotte, l’épidémiologie appliquée à la gestion des risques parasitaires. Comprendre et modéliser les mécanismes d’une maladie d’origine tellurique dans une perspective de protection intégrée. Phytoma 601: 36-40 [pdf]

• Latxague E, Sache I, Pinon J, Andrivon D, Barbier M, Suffert F. 2007. A methodology for assessing the risk posed by the deliberate and harmful use of plant pathogens in Europe. EPPO Bulletin 37: 427-435 http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-2338.2007.01118.x [pdf]

• Desprez-Loustau ML, Robin C, Buée M, Courtecuisse R, Garbaye J, Suffert F, Sache I, Rizzo D. 2007. The fungal dimension of biological invasions. Trends in Ecology and Evolution 22: 472-480 http://dx.doi.org/10.1016/j.tree.2007.04.005 [pdf]

Suffert F, Montfort F. 2007. Demonstration of secondary infection by Pythium violae in epidemics of carrot cavity spot using root transplantation as method of soil infestation. Plant Pathology 56: 588-594 http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-3059.2007.01566.x [pdf]

Suffert F. 2007. Kinetics modelling of the carrot cavity spot caused by a complex of pathogens of the genus Pythium dominated by Pythium violae. Canadian Journal of Plant Pathology 29: 41-55 http://dx.doi.org/10.1080/07060660709507436 [pdf]

Suffert F, Guibert M. 2007. The ecology of a Pythium community in relation to the epidemiology of carrot cavity spot. Applied Soil Ecology 35: 488-501 http://dx.doi.org/10.1016/j.apsoil.2006.10.003 [pdf]

2005

Suffert F. 2005. A theoretical approach to the 'complementation' notion concerning strategies of crop protection. Phytoprotection 86: 89-92 http://dx.doi.org/10.7202/012509ar [pdf]

2003

Suffert F. 2003. L'utilisation volontaire d'agents phytopathogènes contre les cultures. Phytoma 563: 8-12 [pdf]

2002

Suffert F. 2002. L'épidémiologie végétale, nouvelle discipline de guerre ? Lumière sur le bioterrorisme agricole, un enjeu émergent pour la recherche agronomique. Le Courrier de l'Environnement 47: 57-69 [pdf]

 

Encadrement de thèses

Chloé Papin (2023-... ; directeur) "Caractériser l’impact d’associations de variétés de blé sur l’évolution de la structure de virulences d’une population de Zymoseptoria tritici" (ED ABIES)

Cécilia Fontyn (2018-2022 ; directeur) "L’agressivité est-elle une composante significative de l’adaptation au paysage variétal cultivé des populations de Puccinia triticina, agent de la rouille brune du blé ?" (ED ABIES) [résumé & pdf] [publications #1#2#3] [prix Phloème 2022]

Carolina Orellana-Torrejon (2018-2022 ; co-directeur) "Impact d’associations variétales de blé tendre sur la dynamique annuelle d’adaptation d’une population de Zymoseptoria tritici à un gène de résistance qualitative récemment contourné" (ED ABIES) [résumé & pdf] [publications #1, #2, #3] [prix BSPP 2022]

Safa Ben Krima (2017-2020 ; co-encadrant) "Adaptation des champignons phytopathogènes à des peuplements génétiquement hétérogènes : cas du pathosystème blé dur-Zymoseptoria tritici" (ED SEVE) [résumé] [publication #1]

Anne-Lise Boixel (2015-2020 ; co-directeur) "L’hétérogénéité environnementale, un moteur de l’adaptation à la température des populations d’agents phytopathogènes foliaires ?" (ED ABIES) [résumé & pdf] [publications #1, #2] [médaille d’argent Dufrenoy de l’Académie d'Agriculture]

Lydie Kerdraon (2015-2019 ; directeur) "Diversité microbienne et interactions pathogène-microbiome dans les résidus de culture : le cas de Zymoseptoria tritici et Leptosphaeria maculans en système blé-colza" (ED ABIES) [résumé & pdf] [publications #1, #2, #3, #4, #5]

David Morais (2011-2015 ; co-encadrant) "Les déterminants des phases épidémiques précoces de la septoriose du blé (Zymoseptoria tritici) : quantité, efficacité et origine de l'inoculum primaire" (ED ABIES) [résumé & pdf] [publications #1#2, #3, #4]

Frédéric Bernard (2009-2012 ; co-encadrant) "Le développement d'un champignon pathogène foliaire réagit à la température. Mais à quelle température ?" (ED ABIES) [résumé & pdf] [publications #1, #2]

 

Projets

MOBIDIV (PPR ANR 2021-2026). Mobiliser et sélectionner la diversité cultivée intra et inter-spécifique pour un changement systémique vers une agriculture sans pesticide  |  Détails

• COMBINE (ANR 2023-2027). Associer plusieurs variétés pour contrôler les populations d'agents phytopathogènes : Comment résoudre le compromis efficacité / durabilité / technicité et coût-efficacité ?  |  Détails

DURABLASSO (Thèse CIFRE ARVALIS 2023-2026). Caractériser l’impact d’associations de variétés de blé sur l’évolution de la structure de virulences d’une population de Zymoseptoria tritici.

WHEATSECURITY (ERA-NET SusCrop UE 2023-2026). Identification et déploiement durable de la diversité génétique du blé pour renforcer la résilience et la sécurité de l'approvisionnement alimentaire européen   |  Détails

MYCOMIX (SPE INRAE 2024-2026 et BIOSPHERA transverse 2024-2025). Les associations variétales influencent-elles la composition et la structure des communautés fongiques de la phyllosphère et de la résidusphère ?

MICROBIAL RENDEZ-VOUS (INRAE-CSIRO linkage proposal 2024). Les résidus de culture, lieu de rencontre inexploré pour les agents phytopathogènes: opportunités pour le développement de nouvelles stratégies de gestion durable des maladies.

SEED (Métaprogramme INRAE SuMCrop 2021-2022). Incidence de la gestion des semences de blé dur par les agriculteurs tunisiens sur la durabilité du contrôle des maladies.

TREMÄ (Métaprogramme INRAE SuMCrop 2024-2025). Consortium et séminaire tuniso-français sur les résistances aux maladies en grandes cultures.

PROFAS (France-Algérie 2023-2024). Valorisation des blés sahariens et des savoir-faire afférents.

BLADE2025 (IVD4 2021-2025). Blés pour une agriculture durable et écologique.

BASTAFUN (SPE INRAE 2023-2025). Base génomique de l'adaptation multi-stress chez un champignon phytopathogène.

PHECOLLPHYT 1 et 2 (Aviv MNHN 2021-2022 et prématuration Alliance Sorbonne Université SATT Lutech 2023-2025). Utilisation des phéromones de collemboles pour le contrôle des champignons phytopathogènes dans les cultures de blé.

RUSTWATCH (H2020 UE 2018-2022). Système européen d'alerte rapide pour les rouilles du blé  |  Détails

ROUILLENOIRE_2.0 (FSOV 2024-2026). Anticiper la réémergence de la rouille noire du blé en France en couplant épidémiosurveillance et caractérisation de matériel végétal.

MYCORE (OI BASC Paris-Saclay, 2022-2023). Myco-contrôle de la renouée faux liseron par une rouille présente naturellement dans l'environnement.

Date de modification : 02 mars 2024 | Date de création : 01 février 2012 | Rédaction : Frédéric Suffert